Articles

DETECTION OF STRAWBERRY PATHOGENS BY REAL-TIME PCR

Article number
842_44
Pages
263 – 266
Language
English
Abstract
Real-time PCR is described for use in the detection and quantification of the following strawberry pathogens: Verticillium spp. (fungi), Phytophthora cactorum (oomycete), Xanthomonas fragariae (bacteria), and Strawberry crinkle, mottle and mild yellow edge viruses.
Primers for detection of these pathogens were designed by Primer Express Software (Applied Biosystems). In a first approach the use of fluorescent SYBR Green was tested in order to validate primer design for each pathogen and to be used later on to design TaqMan probes in order to increase detection and quantification specificity for those microorganisms.
The sensitivity obtained was 1 bacterium per mg leaf tissue, 1 conidia of V. dahliae per mg root crown and 10-4 ng of total RNA for SMV.

Publication
Authors
J. Cubero, M.A. Ayllón, I. Gell, P. Melgarejo, A. De Cal, P.M. Martín-Sánchez, R.M. Pérez-Jiménez, C. Soria, E. Segundo, I. Larena
Keywords
Verticillium spp., Phytophthora cactorum, Xanthomonas fragariae, virus, diagnosis, quantification
Full text
Online Articles (226)
P.A. Dávalos-González | J. Narro-Sánchez | A.E. Jofre-Garfias | A.R. Hernández Razo | M.N. Vázquez-Sánchez
P. Tongtraibhop | T. Thongthieng | C. Nuengchaknin | C. Pitakpittaya
T. Mochizuki | Y. Yoshida | T. Yanagi | M. Okimura | A. Yamasaki | H. Takahashi
L.M.F. Castañeda | L.E.C. Antunes | N.C. Ristow | S. Carpenedo
Jong-Bun Seo | Gil-Ho Shin | Kyung-Chul Cho | Joung-Keun Kim | Kyong-Ju Choi | Won-Mo Yang
A. Domínguez | E. Martínez | A. Trigo | D. Alonso | R. García | R. Sánchez | R. Ghorbel | J. Tomás
G. Caracciolo | A. Moncada | C. Prinzivalli | F. D'Anna
C. Reisser Júnior | J.C. Carvalho | L.M.F. Castañeda | N.C. Ristow | S. Carpenedo | L.E. Corrêa Antunes
S.K. Kim | H.Y. Na | J.H. Song | M.J. Kim | J.E. Son | R.N. Bae | C. Chun | H.J. Kang
Zhihong Zhang | Linlin Chang | Hongyi Yang | Min Xiao | He Li | Hongyan Dai
O. Daugovish | M. Mochizuki | S. Fennimore
C. Redondo | A. De Cal | A. Martínez-Treceño | M. Becerril | J.M. López-Aranda | P. Melgarejo
C. Redondo | A. De Cal | A. Martínez-Treceño | E. García | D. García-Sinovas | M. Becerril | J.M. López-Aranda | P. Melgarejo
K. Olbricht | G. Staudt | P. Becker | I. Szankowski
F.T. Arroyo | B. De los Santos | F. Romero | J. Moreno | P. Daza | J. Torreblanca
L. Antoniacci | E. De Paoli | C. Montuschi | G. Ceredi | S. Gengotti
B. De los Santos | C. Blanco | F.T. Arroyo | Y. Llergo | F. Romero | C. Soria | J.F. Sánchez-Sevilla | J.M. López-Aranda
J. Cubero | M.A. Ayllón | I. Gell | P. Melgarejo | A. De Cal | P.M. Martín-Sánchez | R.M. Pérez-Jiménez | C. Soria | E. Segundo | I. Larena
A. Aguado | B. De los Santos | F.T. Arroyo | Y. Llergo | C. Blanco | J. Ortega | F. Romero
A. Sombardier | L. Willocquet | D. Blancard | M.F. Corio-Costet | S. Savary | A. Bardet | C. Eckert | Y. Trottin-Caudal | B. Denoyes-Rothan | J.J. Pommier | A. Petit | P. Chartier
N.C. Ristow | S. Carpenedo | R. Trevisan | L.E.C. Antunes | C.J. da Silva Freire
M. Avilés | S. Castillo | C. Borrero | M.L. Castillo | T. Zea-Bonilla | R.M. Pérez-Jiménez
M. Abril | K.J. Curry | A.J. DeLucca | S. Boue | B.J. Smith | D.E. Wedge
M. Mari | S. Gengotti | G. Ceredi | L. Antoniacci | C. Montuschi | E. De Paoli
V.C. Conci | A.K. Torrico | E. Cafrune | V. Quevedo | O. Baino | J.C. Ramallo | A.M. Borquez | V.A. Mollinedo | J.J. Agüero | D.S. Kirschbaum
M. Ragab | K. El-Dougdoug | S. Mousa | A. Attia | I. Sobolev | S. Spiegel | S. Freeman | M. Zeidan | I.E. Tzanetakis | R.R. Martin
R.M. Pérez-Jiménez | E. Segundo | M.P. Carmona | A. González-Vizcaíno | J. Gálvez Farfán | T. Zea-Bonilla | P.M. Martín-Sánchez | I. Amaya | C. Soria | J.M. López-Aranda | J.F. Sánchez-Sevilla
G. Ceredi | L. Antoniacci | C. Montuschi | E. De Paoli | M. Mari | S. Gengotti
T. Kanto | K. Matsuura | M. Yamada | T. Usami | Y. Amemiya
J. Soliveri | M. Arenas | J.L. Copa-Patiño | J.L. Caballero | J. Muñoz-Blanco
P. Parikka | P. Kivijärvi | S. Prokkola | R. Kemppainen
M. Gaskell | M.P. Bolda | J. Muramoto | O. Daugovish
J.C. Shih | T.F. Hsieh | C.C. Ho
Qing-Hua Gao | Zheng-wen Ye | Hong-qing Zheng | Xue-ying Zhang
Li Yang | Li Li | Lei Yang | Baochun Hao | Fengjie Chu
E. Vicente | G. Giménez | A. Manzzioni | F. Vilaró | M. González | M. Cabot
T. Yanagi | P. Nathewet | N. Okuda | K. Sone
P.A. Dávalos-González | J. Narro-Sánchez | A.E. Jofre-Garfias | A.R. Hernández Razo | M.N. Vázquez-Sánchez
A. Refoyo | J.M. Arenas | S. Castillo | M. Avilés
K. Sone | M. Okimura | E. Kitadani | T. Mochizuki | Y. Noguchi | H. Yoshida
E. Montironi | E. Costantini | B. Mezzetti | F. Mourgues | C. Rosati
F. Capocasa | J. Diamanti | S. Pierini | B. Mezzetti
H. Takahashi | A. Yamasaki | K. Shoji | K. Kawagishi | T. Taguchi | Y. Yoshida | M. Morishita
G. Staudt | S. Schneider | P. Scheewe | D. Ulrich | K. Olbricht
M.E. Herrington | L. Woolcock | M. Wegener | M. Dieters | J. Moisander
C. Soria | J.J. Medina | J.F. Sánchez-Sevilla | R. Bartual | A. Refoyo | J. Gálvez | L. Miranda | R. Villalba | M.T. Ariza | J.M. López-Aranda
M.D. Vitten | K. Olbricht | F. Tiedke
M. Alsheikh | R. Sween | A. Nes | M. Gullord
N.C. Ristow | S. Carpenedo | C. Reisser Junior | A.C. Richter Krolow | J.E. Schwengber | L.E.C. Antunes
D.W. Simpson | K.J. Hammond | A.W. Johnson | A.J. Passey | A.B. Whitehouse
T.M. Davis | M.E. Shields | Qian Zhang | E.G. Poulsen | J.L. Bennetzen | K.M. Folta | P. San Miguel
B. Denoyes-Rothan | M. Rousseau-Gueutin | A. Gaston | D. Roca | N. Pedeprat | E. Lerceteau-Köhler | L. Barrot | A. Petit | P. Chartier
A. Moncada | G. Caracciolo | C. Prinzivalli | F. D'Anna
W. Faedi | L. Ballini | G. Baroni | G. Baruzzi | M. Baudino | R. Giordano | P. Lucchi | M.L. Maltoni | M. Migani | L. Placchi
W. Faedi | G. Baruzzi | G. Capriolo | F. D'Anna | P. Lucchi | A. Marano | G. Martelli | C. Mennone | C. Prinzivalli
G. Baruzzi | W. Faedi | P. Lucchi | M. Migani | P. Sbrighi | P. Turci
J.A. García-Gago | J.M. López-Aranda | J. Muñoz-Blanco | F.J. Toro | M.A. Quesada | F. Pliego-Alfaro | J.A. Mercado
W. Njuguna | N.V. Bassil | K.E. Hummer | C. Richards | T.M. Davis
Zhao Mizhen | Wu Weimin | Lei Jiajun | Qian Yaming | Wang Zhuangwei | Yuan Ji
Wu Weimin | Zhao Mizhen | Wang Zhuangwei | Qian Yaming | Yuan Ji
M. Nikolić | J. Milivojević | M. Ivanović
Shuping Yin | K.D. Larson
Jeng-Hsien Tsai | Gwang-Miao Chang | Tian-Yih Wu | Shu-Chen Peng | Hsun-Yao Chang | Su-Jein Chang
B. Mezzetti | R. Nestby | M. Korbin | B. Denoyes-Rothan | B. van Duijn | M. Bodson
M. Turquet | J.J. Pommier | M. Piron | E. Lascaux | G. Lorin
T. Tuovinen | I. Lindqvist | S. Kauppinen | P. Kivijärvi
T. Ikeda | K. Yamazaki | H. Kumakura | H. Hamamoto
D. García-Sinovas | E. García-Méndez | M.A. Andrade | A. de Cal | P. Melgarejo | T. Salto | M.L. Martínez-Beringola | C. Redondo | A. Martínez-Treceño | M. Becerril | J.J. Medina | C. Soria | J.M. López-Aranda
E. García-Méndez | D. García-Sinovas | M.A. Andrade | B. González | J.F. Sánchez-Sevilla | J.M. López-Aranda | J.J. Medina | L. Miranda
A. Martínez-Treceño | P. Chomé | M. Becerril | C. Soria | J.J. Medina | J.M. López-Aranda
F. D'Anna | A. Moncada | G. Caracciolo | L. Guarino | A. Virzì | P. Spata
E.Z. Brandán | R.R. Fernández | E.L. Villagra | S.M. Salazar | C. Cruz | R. Ponce de León
M.S.S. El-Shabasi | M.E. Ragab | I.I. El-Oksh | Y.M.M. Osman
L. Landi | E. Costantini | E. Montironi | B. Mezzetti
M.T. Ariza | J.M. López-Aranda | M.T. Cid-Atencia | C. Soria | J.J. Medina | L. Miranda
A.W. Johnson | O.M. Grant | M.J. Davies | C.M. James | A.J. Passey | D.W. Simpson
J. Rohloff | A.M. Bones | P. Winge | T.S. Jørstad | J. Kopka | A. Erban | A.M. Bones | T. Sparstad | R.C. Wilson | S.K. Randall | J. Davik | M. Alsheikh
V. Luko¿evičiūtė | R. Rugienius | I. Zalunskaite | A. Sasnauskas | V. Stanys
Y.T. Zhang | J. Kong | T.Z. Li | Z.H. Han | G.X. Wang | J. Dong | C.F. Zhong
G. Sarli | A. De Lisi | V. Montesano | D. Schiavone
A. Bolognesi | G. Baruzzi | A. Chatgilialoglu | M. Bortolotti | L. Polito | W. Faedi
R.F.F. Cantillano | L.E.C. Antunes | L.M. Castañeda | R.O. Treptow
N. Tsukamoto | K. Fukuhara | X.X. Li | S. Yamashita | S. Yui | Y. Inaba | M. Okimura | H. Ikeura | Y. Hayata
H. Ikeura | N. Tsukamoto | K. Fukuhara | X.X. Li | S. Yamashita | S. Yui | Y. Inaba | M. Okimura | M. Tamaki | Y. Hayata
J.M. Silva | L.C.S.A. Correia | N.P. Moura | P.L. Salgado | M.I.S. Maciel | H.P. Villar
M.B. Sousa | T. Curado | M.J. Trigo | F.N. Vasconcelos | T. Nunes
C.R. Figueroa | R. Herrera | P. Pimentel | P.D.S. Caligari | M.A. Moya-León
X.X. Li | N. Tsukamoto | K. Fukuhara | S. Yamashita | T. Sakamoto | M. Okimura | Y. Hayata
J.G. Pádua | J. Duarte Filho | C.M. Caproni | R.V. da Mota | L.E.C. Antunes | E.L. do Carmo
E. Kafkas | N. Kemal Koc | S. Paydas Kargı | M.A. Unlü | K. Erçik | A. Kiminsu
M.A. Quesada | S. Posé | N. Santiago-Doménech | R. Sesmero | M.C. Molina | S. Mousa | F. Pliego-Alfaro | J.A. Mercado | J.L. Caballero | J. Muñoz-Blanco | L. Trainotti | G. Casadoro | J.A. García-Gago | J.M. López-Aranda
A.M. León | P. Torres | C. Sanz | A.G. Pérez
S. Voća | B. Duralija | J. Dru¿ić | N. Dobričević | V. Dragović-Uzelac
I. Williams | J.C. Williams | L. Hernández | G. Maya
M.G. Palha | J.L. Campo | L. Reis | T. Curado | M.B. Sousa | C.S. Andrade
J.J. Heller | PH. Sunder | P. Charles | J.J. Pommier | J. Fritsch
J.M. López-Aranda | L. Miranda | C. Soria | R.M. Pérez-Jiménez | T. Zea | M. Talavera | F. Romero | B. De Los Santos | J.M. Vega | J.I. Páez | J. Bascón | F.J. Domínguez | P. Palencia | J.J. Medina
E. García-Méndez | D. García-Sinovas | M.A. Andrade | A. De Cal | P. Melgarejo | T. Salto | M.L. Martínez-Beringola | C. Redondo | A. Martínez-Treceño | M. Becerril | J.J. Medina | C. Soria | J.M. López-Aranda
M.G. Palha | J.L. Campo | T. Curado | M.B. Sousa | P.B. Oliveira
H.S. Yoon | Y.H. Hwang | C.G. An | J.S. Shim | H.J. Hwang | H.Y. Shin
S. López-Galarza | A. San Bautista | A. Martínez | B. Pascual | J.V. Maroto