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In silico development of microsatellites associated with resistance genes to powdery mildew in Vitis vinifera L.
It is among the diseases that attack vineyards in Morocco, it causes significant yield losses and early mortality of vines.
It is therefore essential to understand and identify the resistance mechanisms of grapevine to this disease. In this framework of our work, we have studied sequences analogous to the resistance genes to powdery mildew, for the research of simple sequence repeat (SSR). The total number of microsatellites identified is 516 SSR, the most common of which are tetranucleotides (50%), followed by pentanucleotides (22%), hexanucleotides (13%), trinucleotides (8%), mononucleotides (6%) and dinucleotides (1%). Then, we developed pairs of primers for the SSRs found, with each SSR associated with three pairs of primers.
Résumé:
Loïdium est dû à Erysiphe necator Schwein qui est un champignon biotrophe, appartenant au phylum des Ascomycota. Il se développe sur les cellules épidermiques des surfaces foliaires, à la face inférieure de la feuille.
Il est parmi les maladies qui attaquent la vigne au Maroc, il entraîne dimportantes pertes de rendement et une mortalité précoce des ceps atteints.
Il est donc primordial de comprendre et didentifier les mécanismes de résistance de la vigne à cette maladie.
Dans le cadre de notre travail, nous avons étudié les séquences analogs aux gènes de résistance à loïdium, pour la recherche des SSR (simple sequence repeat). Le nombre total de microsatellites identifiés est de 516 SSR, dont les plus fréquents sont des tétranucléotides (50%), suivis des pentanucléotides (22%), des héxanucléotides (13%), des trinucléotides (8%), des mononucléotides (6%) et des dinucléotides (1%). Ensuite, nous avons développé des paires damorces pour les SSR trouvés, à chaque SSR est associé trois paires damorces.