Articles

Automatic image segmentation as a possible key to detect contamination in in vitro plant tissue culture

Article number
1454_20
Pages
147 – 150
Language
English
Abstract
In vitro micropropagation is vital for modern biotechnology.
Maintaining sterile conditions is an essential pre-requisite, and early detection of fungal and bacterial contamination is crucial for explant recovery.
Artificial intelligence, particularly computer vision, offers a powerful tool for monitoring contamination.
This study presents a system utilizing a YOLOv11-based instance segmentation model for rapid analysis of in vitro cultures.
The system quantifies the contaminated area in images, enabling automatic assessment of contamination progression over time.
Data augmentation ensured good performance even with condensation or suboptimal lighting.
The system is designed for compatibility with compact cameras suitable for automation.

Publication
Authors
L. Capriotti, L. Nepi, A. Mancini, S. Sabbadini, F. Capocasa, R. Pierdicca, B. Mezzetti
Keywords
in vitro culture, contamination, image segmentation, computer vision, deep learning
Full text
Online Articles (75)
J. Schaart | A. Lukasiewicz | M. Juranić
L. Toppino | S. Gattolin | M.R. Tassone | M.T. Azzimonti | G.L. Rotino
C. Montemurro | M. Dellino | M.M. Miazzi | N. Mondelli | S. Presa | D. Orzaez | C. De Giovanni | V. Fanelli | A. Fiore | F. Sevi | G. Diretto | A. Granell
T. Giordani | U. Rogo | S. Simoni | A. Viviani | A. Vangelisti | C. Pugliesi | M. Fambrini | A. Cavallini | L. Natali | R. Michelmore
Wanmei Jin | Xiangyi Sun | Maofu Li | Hua Wang | Yuan Yang | Yanhui Kang | Pei Sun | Jing Dong | Min Jin
V. Súnico | J.J. Higuera | J. Molina Hidalgo | R. Blanco-Portales | E. Moyano | A.M. Maldonado-Alconada | J. Muñoz-Blanco | E. Baraldi | B. Mezzetti | S. Sabbadini | J.L. Caballero
G. Kelly | E. Plesser | E. Bdolach | A. Sherman | Y. Eyal | N. Carmi
P. Punzo | V. Cirillo | S. Esposito | A. Ruggiero | N. D’Agostino | S. Grillo | T. Cardi | A. Nicolia | G. Batelli
C. Pérez-Caselles | E. Yelo | M. Martín-Valmaseda | F.J. Alfosea-Simón | L. Faize | L. Burgos | N. Alburquerque
A. Meira | J. Ferreiro da Costa | P. Ramil-Rego | M. Landin | M.E. Barreal | P.P. Gallego | T.A. Arteta
K. Bertsouklis | D. Vazaka-Vodena | N. Ntoulas | E. Dima | S. Hatzilazarou | S. Kostas | M. Villani
H. Vogel | D. Bascuñán | V. Muñoz | B. González
L. Capriotti | L. Nepi | A. Mancini | S. Sabbadini | F. Capocasa | R. Pierdicca | B. Mezzetti
G. Cáceres-Cevallos | A.A. Lozano-Pérez | A. Bayo-Canha | C. Martínez-Conesa | I. García-Aledo | L. Olivares | M. Quílez-Simón | J.J. Pérez-Cuadrado | P. Romero-Espinar | P. Ros | M. Jordán
J.E. Cos-Terrer | A.A. Lozano-Pérez | M.C. Ballesteros | M. Romero-Muñoz | M. Quílez-Simón | F.J. Vidal-Sánchez | J.M. Gambín | J.J. Pérez-Cuadrado | C. López-Sierra | M. Pérez-Jiménez
V. Fanelli | M.M. Miazzi | S. Procino | C. Fruggiero | L. Cafferati Beltrame | M. Volpicella | I. Mascio | F.L. Aurelio | F. Nigro | L. Susca | V. Montilon | F. Taranto | N. D’Agostino | C. Montemurro
C. Catalano | M. Di Guardo | G. Gusella | L.P. Luca | G. La Quatra | S. Seminara | M. Cortese | G. Polizzi | S. La Malfa | G. Distefano | A. Gentile
M.A. Savoia | I. Mascio | V. Fanelli | M.M. Miazzi | F.L. Aurelio | G. Bottalico | F. Nigro | M. Carlucci | A. Campanale | F. Panara | F. Alagna | L. Lopez | C. Benincasa | E. Perri | R. Nicoletti | C. Montemurro
J. Lempe | S. Schröpfer | L. Baader | M. Moser | E. Asquini | A. Si-Ammour | H. Flachowsky
Hua Wang | Maofu Li | Pei Sun | Yanhui Kang | Xiangyi Sun | Jie Luo | Xin Liu | Min Jin | Wanmei Jin
Hua Wang | Yuan Yang | Maofu Li | Pei Sun | Jing Dong | Xiangyi Sun | Min Jin | Jie Luo | Xin Liu | Wanmei Jin
V. Pavese | L.A. Marino | M. Ferrero | A. Fuda | S. Sabbadini | L. Capriotti | B. Mezzetti | G. Lione | P. Gonthier | D. Torello Marinoni | R. Botta | A. Moglia
G. Lucetti | S. Abbà | G. Pesavento | E. Fanelli | F. De Luca | E. Battagini | S. Cazzaniga | M. Ballottari | D. Frizzon | N. Mori | L. Galetto
V. Ereddia | C. Catalano | F. Salonia | L. Poles | E. Bertini | S. Zenoni | A. Sparacio | D. Oliva | E. Nicolosi | A. Gentile
I. Moshood | W. Skrzypkowski | J.M. Seguí-Simarro | A. Kiełkowska
F. Kelso | E. White | B. Farlow | W. Liu | R. Dewey | K. Da | H. Ashrafi
G. Vaia | V. Pavese | A. Moglia | V. Cristofori | C. Silvestri
F.J. Vidal-Sánchez | S.A. Álvarez | J.M. Gambín | C. López-Sierra | M. Romero-Muñoz | J.M. López-Nicolás | M. Pérez-Jiménez
C. López-Sierra | M. Romero-Muñoz | F.J. Vidal-Sánchez | J.M. Gambín | J.E. Cos-Terrer | M. Pérez-Jiménez
K. Bertsouklis | P. Aroniada | P. Stamatopoulou | A. Paraskevopoulou
M. Romero-Muñoz | J.M. Gambín | C. López-Sierra | F.J. Vidal-Sánchez | M. Pérez-Jiménez
Sz. Kisvarga | K. Horotán | L. Orlóci
N.E. Kafkas | S. Ates | N. Nasır | B. Mezzetti
G.E. Vural | I. Simsek | L. Ozturk Akar | S. Zengin | H.N. Cayak | S.S. Ellialtioglu
L. Ozturk Akar | G.E. Vural | H.N. Cayak | I. Simsek | S. Zengin | S.S. Ellialtioglu | O. Gulsen
M. Martina | C. Morabito | N. Tricerri | A.M. Milani | C. Comino | L. Barchi | A. Moglia | A. Acquadro | F. Secchi | E. Portis
M. Martina | C. Morabito | A.M. Milani | C. Comino | L. Barchi | A. Moglia | A. Acquadro | F. Secchi | E. Portis
A. Amato | G.B. Tornielli | R. Shmuleviz | M. Sandri | P. Zuccolotto | M. Pezzotti | N. Dokoozlian | M. Fasoli | S. Zenoni
I. Mascio | M.A. Savoia | G.A. Vivaldi | V. Fanelli | S. Camposeo | M.M. Miazzi | C. Montemurro
V. De Rosa | E. De Luca | L. Falginella | R. Falchi | A. Vannozzi | E. De Paoli
L. Villao | A. Paguay | B. Briones | E. Santos-Ordóñez