Become a member

Articles

Whole genome resequencing of the globe artichoke Italian ecotype ‘Asti Sorì’

Article number
1439_75
Pages
563 – 568
Language
English
Abstract
‘Asti Sorì’ (or ‘Carciofo Astigiano del Sorì’) is a globe artichoke local ecotype cultivated in the hills of Asti (Italy), recognized as a presidium by the “Slow Food Foundation for Biodiversity”. With the aim to enhance its preservation as well as to accelerate the valorization and breeding of this ecotype, we performed an Illumina re-sequencing of two ‘Asti Sorì’ genotypes achieving coverage up to 35×. We reconstructed their genome sequences at a chromosomal scale, conducted structural and functional annotations, and compared them to previously available sequences from genotypes representing the globe artichoke core varietal types and a genotype of the related taxa cultivated cardoon.
This work contributes to increasing the existing globe artichoke genomic resources and paves the way for the safeguarding of this Piedmont landrace.

Publication
EHC2024: International Symposium on Genetic Resources in Horticulture: Screening, Propagation, Use, and Conservation
Authors
M. Martina, E. Vergnano, L. Gaccione, A. Acquadro, C. Comino, L. Barchi, R. Giordano, C. Carli, E. Portis
Keywords
agrobiodiversity, NGS (next generation sequencing), sequencing project
Full text
https://doi.org/10.17660/ActaHortic.2025.1439.75
Online Articles (75)
C. Vînătoru | B. Mușat | M. Popescu | C. Bratu | G. Negoșanu | F. Burlan | C. Şomoiag
R. Vollmer | J. Soto-Torres | J. Espirilla | A. Espinoza | R. Villagaray | A. Mello | V. Azevedo
T.D. Stoilova | N.V. Velcheva
A.V. Zăgrean | I.C. Rusu | G. Șovărel
A. Avagyan | G. Martirosyan | G. Sargsyan | G. Adjemyan | L. Tadevosyan | R. Balayan | A. Pahlevanyan
M. Höfer | H. Flachowsky
V.M. Mezhenskyj | V.K. Ryabchun | L.S. Yuryk
A.M. Stoenescu | N. Gheorghiu | S.N. Cosmulescu
L.C. Mărăcineanu | N. Giugea | D.D. Cichi | R. Căpruciu | D.C. Costea
N. Jouini | M. Lambardi | C. Benelli | W. Tarraf | T. Izgu | M.A. Germanà
N. Krigas | E. Karapatzak | I. Anestis | I. Samartza | E. Pipinis | S. Kostas | S. Hatzilazarou | G. Tsoktouridis
C. Hubert-Schöler | L. Raschka | K. Luhmer | M.D. Moll | R. Pude
N. Sahin
T.D. Stoilova | N.V. Velcheva
O.L. Agapie | E. Barcanu | B.E. Kivu | I. Gherase | G. Dobre
M. Popescu | C. Vînătoru | B. Mușat | C. Bratu | G. Negoșanu | F. Burlan | C. Şomoiag
E. Teodorescu | E. Barcanu
I. Bender | P. Põldma | J.-S. Tamm | B. Koll | I. Roman | A. Michelson | K. Annamaa
A. Avagyan | A. Pahlevanyan | R. Balayan | G. Martirosyan | G. Adjemyan | I. Tsereteli | L. Tadevosyan
A.E. Alexandrescu (Manolescu) | C.F. Popescu | A. Popescu | A.M. Dumitru | D.I. Sumedrea | S.N. Cosmulescu
L. Leto | A. Agosti | S. Nazeer | L. Del Vecchio | A. Di Fazio | V. Guarrasi | T. Ganino | J. Juan-Vicedo | E. Rolli | M. Cirlini | B. Chiancone
N. Guilhot | J. Labrosse | I. Farrera | G. Perez | F. Meunier | M. Roth | M. Lefèbvre | M. Labadie | S. Jay | M. Weiss | E. Costes | F. Boudon
N. Braniște | M. Militaru | M. Butac | E. Mareși
V.M. Mezhenskyj | L.A. Shevchuk | S.P. Kovalchuk
E. Mendelné Pászti | G. Bujdosó | Á. Mendel
A. Florea | D.I. Sumedrea | A.M. Dumitru | A.E. Manolescu | C. Ciobotea | D. Dinu
J. Kim | S-K. Song | K. Park | C. Hee Lee | H. Lee
S.S. Dhumal | P.B. Shinde | S.A. Sarvade | R.D. Pawar | U.S. Shinde
G. Tsoktouridis | N. Krigas
C. Tränkner | L. Carter | L.M. Montejano Rodriguez
M. Lupo | V. Cristofori | C. Silvestri
M. Neves | S. Correia | J.M. Canhoto
N. Jouini | E. Baltazar | T. Lopes | M. Correia | M.A. Germanà | J.M. Canhoto | T. Caruso
S. Nazeer | A. Agosti | L. Leto | B. Chiancone
L.D. Vlasin | Zs. Jakab-Ilyefalvi | I. Zagrai | L.A. Zagrai
J. Šedivá | D. Zahradník | Z. Špíšek
T. Natalchuk | T. Medvedeva | N. Yaremko | K. Udovychenko
T.T. Tzatzani | I. Mylonaki
P. Carraro | D. Bujazha | L. Buzzicotti | L. Ravazzolo | C. Bonghi | E. Sgaravatti | G. Zanin | F. Tosini | D. Fanelli | A. Chichi | M. Giannini | B. Milic | N. Magazin | S. Quaggiotti | B. Ruperti
M. Falaki Khalilsaraee | N.T. Meti
V. Gianguzzi | L. Leto | A. Agosti | S. Nazeer | L. Del Vecchio | A. Di Fazio | F. Sottile | J. Juan-Vicedo | E. Rolli | M. Cirlini | B. Chiancone
S. Karras | E. Kartsonas | A. Alexopoulos | A. Darras | I. Lykoskoufis
I. Zagrai | L.A. Zagrai | M. Ravelonandro | R. Scorza | C. Dardick | N. Minoiu | P. van der Meer
G. Vighi | M. Rymenants | N. De Storme
L.A. Zagrai | I. Zagrai | C. Moldovan | S.D. Roșu-Mareș | G.M. Guzu | L.D. Vlasin
A. Radović | D. Nikolić | D. Milatović | I. Radović | S. Savić
N. Krigas | I. Anestis | E. Pipinis | S. Kostas | E. Papaioannou | E. Karapatzak | K. Paschalidis | D. Lazari | S. Hatzilazarou | G. Tsoktouridis
S. Stelluti | N.M. Falla | S. Ravetto Enri | M. Lonati | G. Lombardi | V. Scariot
M. Martina | N. Gianoglio | L. Barchi | C. Milanesi | A. Acquadro | E. Portis
A. Gerrano | R. Vernooy
J. Jenwithee | N. Nitwatthanakul | A. Tira-umphon
G. Negoșanu | C. Vînătoru | V.A. Ion | B. Mușat | M. Popescu | A. Asănică
E. Gorbe | A. Rausell-Moreno | E. Martínez-Ispizua | M.R. Martínez-Cuenca | Á. Calatayud | C. Penella
A. Veres | J. Bedő | Z. Kovács | A.K. Tóth-Lencsés | B. Pápai | E. Kiss | A. Szőke
S. Kafkas
S. Kafkas
S. Doğan | C. Şimşek | İ. Soylu | H. İkten | A. Sabır | D. Şimşek | N. Mutlu
D. Zadehdabbagh | S. Khorasaninejad | M. Mahmoudi Sourestani
S. Pluta
E. Santos-Ordóñez | E. Sánchez-Timm | L. Villao-Uzho
G. Bujdosó | V. Varjas | K. Cseke
I. Granata | A.S. Balan | F. Bonanno | N. Jouini | T. Caruso | M.A. Germanà | A. Giovino | F.P. Marra | A. Marchese
E. Mareși | A. Iancu | M. Militaru
S. Keller-Przybyłkowicz | M.A. Lewandowski | A. Walencik | K. Strojny | M. Michalecka
K. Udovychenko | T. Kondratenko | J. Skytte af Sätra | L. Garkava-Gustavsson
L. Karapetsi | E.D. Pratsinakis | T. Sotiropoulos | G. Pantelidis | K. Ziakou | P. Drogoudi | P. Madesis
G. Tranchina | F. Bonanno | A.S. Balan | F.P. Marra | T. Caruso | A. Giovino | G. Belvisi | A. Marchese
G. Merkouropoulos | G. Doupis
A. Arciniega de los Santos | C. Castillo | R. Arroyo-García | G. Muñoz Organero | M.M. Hernández | C.M. Menéndez
R. Natale | M. Martina | E. Vergnano | A.M. Milani | A. Prina | D. Paffetti | L. Andrenelli | E. Portis
P. Cerruti | C. Campobenedetto | C. Agliassa | V. Contartese | E. Montrucchio | M. Martina | C. Bertea | A. Acquadro
F. De Marchi | L. Gaccione | A. Moglia | A.M. Milani | D. Valentino | L. Barchi | E. Portis | P. Gramazio | J. Prohens | A. Acquadro | C. Comino
B. Mușat | C. Vînătoru | M. Popescu | C. Bratu | G. Negoșanu | F. Burlan | C. Şomoiag
S.S. Song | S.W. Xia | Y. Li | B. Liu | X.X. Li | Y.S. Lai
M. Martina | E. Vergnano | L. Gaccione | A. Acquadro | C. Comino | L. Barchi | R. Giordano | C. Carli | E. Portis